Wendel speelde in de jeugd van Tigres do Brasil en Fluminense. Hij debuteerde op 15 maart 2017 in het betaald voetbal. Hij kreeg die dag een basisplaats bij Fluminense tijdens met 3–2 gewonnen wedstrijd in de Copa do Brasil, thuis tegen Criciúma. Zijn debuut in de Série A volgde op 14 mei 2017. Ook die dag stapte hij van het veld na een 3–2 overwinning, ditmaal op Santos. Wendel maakte op 18 juni 2017 voor het eerst een doelpunt als profvoetballer. Hij zorgde die dag voor de 1–0 tijdens een competitiewedstrijd die in 2–2 eindigde, thuis tegen Flamengo.